9.基于线粒体DNA和核DNA遗传标记的中华鲟种属鉴定

作者：杨子豪、夏若成、蒋志伟、蒋婷婷、陈开琴、吴晓连、陶瑞旸、杜志淳（华东政法大学刑事法学院，司法鉴定科学研究院，上海市法医学重点实验室，上海市司法鉴定专业技术服务平台，司法部司法鉴定重点实验室，温州医科大学基础医学院，南方医科大学法医学院，遵义医科大学基础医学院司法鉴定科学研究院）

内容提要：目的构建一种基于线粒体DNA和核DNA遗传标记的中华鲟及其潜在杂交种的鉴定方法。方法根据美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information, NCBI）已公布的中华鲟cytb基因序列设计引物，并选用鲟鱼单拷贝核基因fam43a扩增引物对中华鲟DNA进行扩增与测序，其中对fam43a基因扩增产物进行TA克隆测序。通过BLAST序列相似性检索确定样本来源，并基于邻接法构建鲟形目系统进化树。结果中华鲟样本测序所得cytb和fam43a基因序列长度分别为728 bp和730 bp，且10个克隆群所测fam43a基因序列完全一致。基本局部比对搜索工具（basic local alignment search tool, BLAST）序列相似分析显示，所测cytb与fam43a基因序列均与GenBank数据库中的中华鲟相似性最高，相似性分别为99.86%和100%。系统进化分析显示，中华鲟样本所测得序列均与GenBank数据库中的中华鲟DNA序列聚类在一起，且与鲟形目其他物种位于不同分支。结论联合使用线粒体DNA和核DNA遗传标记能够快速准确地鉴定中华鲟及其潜在杂交种，该方法能够满足法医日常检案的鉴定需求，为中华鲟的拯救和保护提供科学技术支持。

关键词：法医遗传学；cytb基因；fam43a基因；中华鲟；种属鉴定